OSをバージョンアップして、MacBook Pro（Late 2011）にOS X 10.9.3 Mavericksを入れてみました。これまでOSはバグなどもあまりなく安定しており使い慣れた古い版のままでいいやとずっと思っていましたが、走らせてみたい新しいソースコードの対応具合や使っ…

日本語では空飛ぶモンティ・パイソンと訳されていますが、原語だと"Monty Python's Flying Circus"と言うそうです。この日本語では露に訳されなかったcircusというのは、もちろん、サーカスという意味もあるけれど、 circus: 愉快で騒がしいもの[出来事，人]…

大阪大学データ科学特論I 2013/08/29 今泉忠「モールスコードデータの分析 ー 中年男性の危機を乗る越えるためにー」 http://stat.tama.ac.jp/Lectures/npxlob/616aqv データファイルなど http://stat.tama.ac.jp/Lectures/npxlob/ クラスター分析の資料とと…

もともと、いろいろなRのパッケージの関数を使ってみようと思って計算していたら、stress1とstress2、Sammon stress、strainなどいろいろなstress（"badness-of-fit"の指標）が出て来て、どう比較したり解釈したりすればいいのか迷ったので調べ始めました。…

古典的MDS：cmdscale() http://www.mathworks.co.jp/jp/help/stats/examples/classical-multidimensional-scaling.html 非古典的MDS：mdscale() http://www.mathworks.co.jp/jp/help/stats/examples/non-classical-multidimensional-scaling_ja_JP.html 多変…

パッケージ名を{}の中に記し、関数名にはその後に()をつけることにする。 MDS {stats} cmdscale() MDSの応用例 {randomForest} MDSplot()：ランダムフォレストの結果求まった類似度（rf$proximity）を非類似度に変換（1 - rf$proximity）したものをMDS（cmds…

Edwards, J & Oman, P: "Dimensional Reduction for Data Mapping: A practical guide using R" http://cran.r-project.org/doc/Rnews/Rnews_2003-3.pdf 下記の元ネタ論文でg54データの生成コードが付いている。prcomp(), cmdscale(), sammon(), isoMDS(), f…

社会科学やマーケティングでは、positioning（ポジショニング）という用語があるそうです。特にブランドの分析するときなど。また、官能検査／試験／評価という分野でも多変量解析が用いられるらしい。ブランドx評価者x評価項目のような多元（多相）データを…

生態学（ecology）ではordination（座標づけ、順序づけ、序列化）という用語があるそうです。初めて知りましたがとても興味深いです。 "Ordination Methods for Ecologists" http://ordination.okstate.edu/ に体系的にまとめられています。Rでordinationを…

多変量データの可視化に興味があります。多変量解析というキーワードで統計手法を調べると、たくさんありすぎて目が回る！というような経験を一度はされたことのある方も多いはず。データの種類や目的、思想や仮定（assumption）、分野によって呼び方が違っ…

広がりが途方もなく、はまったのでメモしておこう。 さて、どこから書けばいいのか、整理が下手なのでどうしようか。